No pasa nada,
Es un warning. Que que te dice que el paquete que tienes instalado está hecho con la versión XXX y tu tienes otra.
Normalmente las versiones de los paquetes más usadas están actualizados con la última versión de R.
La clave es tenerla versión de R actualizada para evitar problemas.
Yo no borro las versiones anteriores normalmente. Pero si que de vez en cuando reseteo la carpeta y lo borro para que no haya problemas de versiones y tal.
La clave como te digo es tener el software actualizado.
Abrazos,
